dbPTM

PTM General Information

PTM Description

Ubiquitinlysine

Modified Amino Acid

K

Position of Modification on Amino Acid

amino-acid side chain

Position in the Polypeptide

any position

Correction Formula

H-3;N-1

Monoisotopic Mass Difference

17.0265

Average Mass Difference

17.03

Localization

extracellular and lumenal localisation [Detail]

RESID ID

Formula Structure

Substrate Site Specificity

Number of Experimentally Validated Sites

The Matrix of Positional Amino Acid Frequency Surrounding Modified Site

Pos.	-6	-5	-4	-3	-2	-1	0	+1	+2	+3	+4	+5	+6
A	0.07	0.07	0.07	0.07	0.08	0.07	0	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07
R	0.07	0.05	0.05	0.05	0.04	0.04	0	0.05	0.05	0.05	0.06	0.07	0.06
N	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04
D	0.06	0.06	0.06	0.05	0.06	0.05	0	0.06	0.05	0.06	0.06	0.06	0.05
C	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01
G	0.06	0.05	0.05	0.06	0.05	0.07	0	0.06	0.07	0.06	0.05	0.06	0.06
E	0.08	0.08	0.09	0.1	0.07	0.09	0	0.09	0.07	0.09	0.09	0.08	0.08
Q	0.05	0.05	0.04	0.06	0.05	0.07	0	0.06	0.05	0.06	0.06	0.05	0.05
H	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02
I	0.05	0.05	0.05	0.05	0.06	0.06	0	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05
L	0.1	0.1	0.11	0.1	0.13	0.12	0	0.1	0.15	0.1	0.11	0.1	0.09
K	0.07	0.07	0.06	0.05	0.05	0.03	0	0.04	0.05	0.06	0.06	0.07	0.07
M	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02
F	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0	0.05	0.06	0.04	0.04	0.04	0.04
P	0.04	0.05	0.05	0.05	0.05	0.04	0	0.05	0.04	0.05	0.05	0.05	0.05
S	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.08	0	0.06	0.06	0.07	0.07	0.07	0.07
T	0.05	0.05	0.05	0.06	0.05	0.05	0	0.06	0.05	0.06	0.05	0.05	0.05
W	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01
Y	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03
V	0.07	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.07

Sequence Logo

Average Solvent Accessibility Surrounding Modified Site

Secondary Structure Logo