dbPTM

PTM General Information

PTM Description

N6-malonyllysine

Modified Amino Acid

Position of Modification on Amino Acid

amino-acid side chain

Position in the Polypeptide

any position

Correction Formula

C9;H14;N2;O4

Monoisotopic Mass Difference

214.095

Average Mass Difference

214.22

Localization

cytoplasm, nucleus, mitochondrial matrix, etc. [Detail]

RESID ID

AA0568

Formula Structure

Substrate Site Specificity

Number of Experimentally Validated Sites

11973

The Matrix of Positional Amino Acid Frequency Surrounding Modified Site

Pos.	-6	-5	-4	-3	-2	-1	+1	+2	+3	+4	+5	+6
A	0.08	0.08	0.08	0.08	0.09	0.08	0.09	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08
R	0.06	0.06	0.06	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.05	0.05	0.06	0.06
N	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03
D	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.06	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05
C	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02
G	0.06	0.06	0.07	0.07	0.07	0.09	0.08	0.07	0.08	0.06	0.07	0.07
E	0.07	0.07	0.08	0.08	0.06	0.08	0.08	0.06	0.08	0.08	0.07	0.07
Q	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05
H	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02
I	0.06	0.06	0.05	0.05	0.07	0.05	0.06	0.07	0.05	0.05	0.05	0.06
L	0.1	0.11	0.08	0.1	0.11	0.11	0.09	0.12	0.08	0.09	0.09	0.1
K	0.09	0.1	0.09	0.09	0.08	0.07	0.05	0.05	0.08	0.08	0.09	0.09
M	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02
F	0.04	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04
P	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.05	0.06	0.05	0.05	0.04	0.04
S	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05
T	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05
W	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01
Y	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02
V	0.08	0.08	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07

Sequence Logo

Average Solvent Accessibility Surrounding Modified Site

Secondary Structure Logo